Главный герой – Эдвард Кенуэй, отец Хэйтама Кенуэя и дед Коннора Кенуэя (соответственно, антагониста и протагониста Assassin's Creed III). Это дерзкая, харизматическая, бесстрашная и самоуверенная личность, гений пиратства. В первую очередь, Эдвард считается пиратом, и лишь во вторую – ассасином. Он может переносить до четырех огнестрельных оружий. Кроме того, доступны абордажные сабли, кинжалы, мечи и тому подобные оружия.

4 марта 2013 года стало известно, что события «Черного Флага» будут происходить преимущественно в XVIII веке, в таких уголках планеты, как Флорида, Куба, Багамы и Нассо. Пиратство образца 1715 года в Black Flag показано в серьезном ключе, без комедийных приемов: это промысел, основанный на убийствах и грабеже. Игровые пираты основаны на реальных личностях, включая Черную Бороду, Чарльза Вейна, Калико Джека, Энн Бонни, Бенджамина Хорниголда. Кроме того, присутствует вариация Джека Воробья. Тогда как в Assassin's Creed III основой было вымышленное повествование, в Assassin's Creed IV: Black Flag важнейшую роль играют события, происходившие в реальной истории. Например, есть нападение Бартоломью Робертса на 42 португальских корабля. Ubisoft сообщает об открытом мире с тропическими штормами, гарпунной охотой на китов и подводным геймплеем, происходящим в результате кораблекрушений. 

Примерно 40% геймплея будет проходить в море, соответственно около 60% – на суше. Обещано «50 уникальных локаций», включая рыбацкие деревни, джунгли, храмы, плантации, форты, руины Майя и острова. Каждая область связана с особым типом геймплея. Так, в руинах Майя нужно решать головоломки и проходить платформенные секции, а на Кокосовых островах – сражаться с аборигенами. Три крупнейших города – Нассо (пристанище пиратов), Кингстон (оживленный и опасный город) и Гавана (столица Кубы). Многие обновления и настройки осуществляются посредством корабля Кенуэя, «Джекдро». Обновлению поддается и пиратская команда. Для обнаружения удаленных кораблей и островов используется подзорная труба. В исследовании моря будут реализованы концепции из Metroidvania: изначально доступ к определенным областям закрыт. В качестве главных противников будут возвращены тамплиеры. Кроме того, протагонисту будут противостоять конкуренты по пиратской стезе.

Специальное издание включает в себя дополнительный контент:

DLC Потерянные секреты

Потерянный остров (миссия для одиночной игры)
Одежда капитана Дрэйка (костюм для одиночной игры)
Две сабли (оружие для одиночной игры)
Два кремневых пистолета (оружие для одиночной игры)
DLC Наследие капитана Кенуэя

Две золотые сабли (одиночная игра)
Костюм охотника за сокровищами (мультиплеер)